Une étape d’un chemin de Saint-Jacques
Ancienne villa aquitano-romaine à laquelle le dignitaire romain Muscius a donné son nom, Mouchan est situé sur l’une des voies qui reliaient Agen à Eauze. En 1060, une église accueillant les reliques de saint Austrégésile y est consacrée ; elle est donnée en 1089 à Cluny, qui y implante une communauté monastique. L’église est alors reconstruite, des bâtiments conventuels sont érigés et un bourg naît aux portes du prieuré. Sur un des chemins menant du Puy à Saint-Jacques-de-Compostelle, l’établissement est directement rattaché au grand prieuré clunisien de Saint-Orens d’Auch dès 1264. Sous la protection du roi de France, Mouchan subit des rétorsions des troupes du prince de Galles, en 1368-1369, lors de la guerre de Cent Ans : les bâtiments sont fortement endommagés. Malgré ses fortifications du XVe s., le prieuré est détruit par les troupes protestantes de Montgomery en 1569, et son église abîmée. Dès 1581, ses propriétés sont affermées et la présence clunisienne disparaît à partir de cette époque. 
Un précieux témoignage de Cluny dans la région
De l’ensemble prieural, seule l’église Saint-Austrégésile, du XIIe s, composée d’une nef de deux travées, d’un transept et d’une profonde abside, subsiste aujourd’hui. La tour carrée qui flanque l’abside au sud lui est antérieure. 
